Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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