Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf149Q3U2C5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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