Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hace1Q3U0D9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms