Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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