Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms