Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms