Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms