Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms