Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Olfr1329-201ENSMUST00000071979 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Gm18859-201ENSMUST00000118792 825 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Chd8Q09XV5 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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