Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms