Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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