Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm6236-201ENSMUST00000193785 1009 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm29794-201ENSMUST00000218919 1247 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms