Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Kcnb1Q03717 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Kcnb1Q03717 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Kcnb1Q03717 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Kcnb1Q03717 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Kcnb1Q03717 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Kcnb1Q03717 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Kcnb1Q03717 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Kcnb1Q03717 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Kcnb1Q03717 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms