Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl7Q03366 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms