Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Thbs2Q03350 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Thbs2Q03350 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Thbs2Q03350 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Thbs2Q03350 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Thbs2Q03350 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Thbs2Q03350 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms