Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp11Q02853 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms