Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms