Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GscQ02591 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
GscQ02591 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
GscQ02591 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
GscQ02591 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GscQ02591 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms