Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Zfp39Q02525 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms