Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms