Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoa1Q00623 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms