Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp9bP98195 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp9bP98195 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp9bP98195 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atp9bP98195 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atp9bP98195 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Atp9bP98195 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Atp9bP98195 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Atp9bP98195 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Atp9bP98195 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Atp9bP98195 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Atp9bP98195 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp9bP98195 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Atp9bP98195 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms