Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Scn1bP97952 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Scn1bP97952 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms