Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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SgcdP82347 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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SgcdP82347 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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