Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms