Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.8 ms