Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
UbdP63072 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
UbdP63072 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
UbdP63072 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
UbdP63072 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
UbdP63072 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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