Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ufm1P61961 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ufm1P61961 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufm1P61961 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms