Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snap25P60879 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snap25P60879 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snap25P60879 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snap25P60879 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms