Protein–RNA interactions for Protein: P58545

Btbd3, BTB/POZ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd3P58545 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Btbd3P58545 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Btbd3P58545 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms