Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PitpnbP53811 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms