Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Tmod1P49813 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Tmod1P49813 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Tmod1P49813 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Tmod1P49813 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Tmod1P49813 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Tmod1P49813 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Tmod1P49813 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Tmod1P49813 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Tmod1P49813 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmod1P49813 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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