Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtpreP49446 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PtpreP49446 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms