Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkn1bP46414 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms