Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VhlP40338 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VhlP40338 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms