Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Timp3P39876 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Timp3P39876 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms