Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hoxc11P31313 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hoxc11P31313 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc11P31313 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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