Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprmP28828 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprmP28828 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprmP28828 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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