Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
RxrbP28704 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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