Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RxraP28700 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RxraP28700 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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