Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Eif3aP23116 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms