Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms