Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms