Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ntf3P20181 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms