Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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NelfeP19426 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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