Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18526 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18526 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P18526 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18526 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18526 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18526 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18526 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18526 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18526 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18526 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18526 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18526 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18526 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18526 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18526 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18526 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18526 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18526 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18526 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18526 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms