Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Hoxb1P17919 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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