Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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