Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms