Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms